Elizabeth Shaw (Noomi Rapace) y Charlie Holloway (Logan Marshall-Green) quieren saber más, quieren conocer el porqué del origen de la vida en la Tierra. Tras su último hallazgo, deciden aceptar lo que ellos interpretan como una invitación de parte de los "ingenieros" de la vida, enviada durante siglos desde el otro lado del universo. Ese es el objetivo del viaje que lleva a la tripulación de la nave Prometheus hacía un planeta desconocido; la búsqueda de las respuestas a las siempre dramáticas preguntas: ¿Quiénes somos? ¿De dónde venimos?
Prometeo desafío a los dioses al entregar fuego a los humanos y tratar a esos como iguales. Los tripulantes de la nave Prometheus, también retarán a los ingenieros, a "los dioses", a esos que en teoría son los creadores de la vida en la Tierra. Puede que las preguntas anteriores no tengan nunca una respuesta definitiva, ya que, al igual que ocurre con el dilema de "¿quién fue primero, el huevo o la gallina?", puede entrar en bucle. Muchas preguntas y pocas respuestas; o puede que una que los personajes se niegan a aceptar.
